كشفت صحيفة "يديعوت أحرونوت" في تحقيق لها عن وجود خلاف داخلي بين الأذرع الأمنية والاستخباراتية في "إسرائيل"، مثل جهاز الشاباك وأمان، وبين القيادة السياسية بشأن التعامل مع قضية الأسرى الفلسطينيين. وأوضحت الصحيفة أن الجهات الاستخباراتية تميل إلى التوصية بإجراء صفقات تبادل أسرى كوسيلة فعّالة لاستعادة الأسرى، بينما تُصر القيادة السياسية على رفض هذه الفكرة خوفًا من أن تُفسَّر كخضوع لحركة حماس.
وأشارت الصحيفة إلى أن هناك فشلًا استخباراتيًا في التقدير والتخطيط، حيث كان من المتوقع أن تتوافر لدى "إسرائيل" معلومات دقيقة حول مواقع احتجاز الأسرى، إلا أن العمليات الميدانية أظهرت مرارًا غياب هذه المعطيات، ما يزيد من تعقيد الوضع. كما أكدت "يديعوت أحرونوت" أن "إسرائيل" نفذت غارات على مناطق يُعتقد بوجود أنفاق اعتقال فيها، دون التنسيق مع الجهات المعنية بملف الأسرى.